中經院所做的研究報告，完全未考量廠商投資區位選擇對台灣國內經濟的衝擊。最明顯的事證就是：中經院的研究報告並未針對簽ECFA後，台灣經濟是否將會出現克魯曼教授所說的「軸心－輪輻」（hub－spoke）效應進行探討。此種效應會因中國繼續阻撓台灣與東協以及其他主要國家簽署FTA而加速進行，使台灣徹底邊陲化。

在中國繼續阻撓台灣與東協以及其他主要國家簽署FTA情形下，台灣若先與中國簽ECFA，此時台灣廠商若選擇繼續留在台灣投資生產，所生產的商品輸往中國雖可享受ECFA關稅優惠，但輸往東協國家時，卻無法享受關稅優惠；這個廠商若改到中國投資生產，則在中國生產的商品輸往台灣與東協國家皆可享受關稅優惠，再加上中國市場規模大於台灣的市場優勢，簽ECFA後，台灣廠商勢必大規模西進以享受「中國軸心」的優勢，台灣將會出現第二波產業外移。

多數廠商選擇投資中國後，勢必同時削減這些廠商投資台灣的規模，除造成民間投資不足，資本累積速度變慢外，亦會減緩新技術引進的速度，使得新工作機會增加速度不夠，受薪階層的薪資所得將更難增加。

馬政府同時亦忽略了中國生產的商品亦可零關稅銷往台灣的嚴重問題。簽ECFA後，不少以台灣為市場的廠商將會隨第二波產業外移而赴中國投資生產，再將在中國所生產商品低價銷回台灣，導致原在台灣生產的廠商不是被迫移往中國，不然只好關廠歇業，對勞工工作機會產生極大影響。